As Áreas de Preservação Permanente (APPs) presentes no campus de Lajeado são constantemente monitoradas e protegidas.
Atualmente a Univates tem uma área de mais de 80 mil m² de APP demarcada e protegida, além de contar com um inventário florestal que é atualizado periodicamente conforme ocorrem mudanças nos estágios de vegetação na área do campus. O inventário florestal é aprovado pela Secretaria de Meio Ambiente de Lajeado. Por meio do Inventário Florestal da Univates foi possível identificar uma riqueza de 88 espécies vegetais arbóreas, pertencentes a 36 famílias botânicas.
A Instituição conta ainda com diversas áreas de reposição florestal, locais onde realizamos o plantio de diversas mudas nativas para compensar os impactos das atividades. Após o plantio, realizamos o monitoramento, coroamento e as adubações para que as mudas se desenvolvam. A equipe prioriza que estes plantios de compensação sejam realizados em áreas próximas aos fragmentos florestais já existentes no campus, que somam uma área verde maior que 238 mil m², pois assim se expandem os remanescentes de vegetação, permitindo um maior espaço para o desenvolvimento da fauna que ali habita. Conforme dados do Inventário Florestal, destes fragmentos florestais, 36,39% estão em estágio inicial de regeneração, 27,01% estão em estágio médio de regeneração e 6,94% em estágio avançado de regeneração, propiciando uma grande variedade de habitats no interior da floresta para garantir o equilíbrio das populações da fauna e da flora.
