Resumo: Este estudo é qualitativo, descritivo e exploratório. Seu objetivo foi conhecer a percepção dos profissionais sobre a aplicação dos princípios da equidade, justiça e autonomia em seu processo de trabalho. Foram entrevistados profissionais que atuam em duas unidades com Estratégia Saúde da Família. A análise dos dados foi realizada segundo a análise de conteúdo temática. Os resultados demonstraram que a maioria dos profissionais da saúde conhece o conceito dos princípios e afirma praticá-los, mas alguns fatores como a grande demanda de usuários, as equipes pequenas, a pouca infraestrutura do local, a falta de tempo, a burocracia e a hierarquia do sistema acabam interferindo na dinâmica do atendimento. A organização do serviço visa a atender as demandas da população. Sugere-se que a equipe reflita sobre esta situação, para que os princípios possam ser utilizados como ferramentas na resolução de conflitos éticos.

Palavras-chave: Princípios do SUS. Princípios bioéticos.